Миссионерские рейсы корабля-церкви в отдаленные места области проводятся каждый год в конце лета. Инициатором этих поездок выступило в 1996 году Новосибирское епархиальное управление. Корабль, задействованный для этого, оборудован специальным помещением, напоминающим церковь, и освящен в честь святого апостола Андрея Первозванного – одного из первых учеников Христа и проповедников христианства. В отдаленных деревнях появление корабля-церкви узнают по колокольному перезвону, который раздается перед тем, как судно причалит к берегу.

По прибытии в населенные пункты для жителей будут организованы приемы врачей, социального педагога, психолога, нарколога и геронтолога, безвозмездная передача медикаментов, продажа очков по доступным ценам, а также концерты духовных песнопений православного хорового коллектива. Кроме того, все желающие смогут принять таинства Крещения, Причастия, исповеди, индивидуально побеседовать со священником, приобрести духовную литературу.